台湾地区“行政院长”林全18日针对金门马祖“小三通”航商因连年亏损酝酿停航一事表示，会请交通部门进行了解，在政策上来看，原有的“小三通”航线有它的意义，希望让航线继续维持。
中国国民党立委陈雪生当天在“立法院”总质询时指出，金马“小三通”航线除金门到厦门外，金门到泉州、马祖到马尾的航线都处于客源不足的状态，目前经营的两家航商过去几年一直在亏损，酝酿在11月1日准备停航。
若停航无法“维持现状”
陈雪生表示，“小三通”航线停航涉及到两岸关系，若是停航就代表无法维持现状，这可以停航吗？尤其目前两岸关系在这么严峻的情况下，若是停航，在政治上是什么样的考量？“小三通”既然是当局的政策，希望林全能在政策上做指示，可依照预算法动支第二预备金协助解决。
陈雪生说，“小三通”政策在台湾是由交通部门订定、航港局管理，应在基本需求上辅导补助，起码让这些航商能继续开船，等到达一定人数时再停止补助，若是停航重新招标，明知道会亏损，还会有人去吗？
林全回应称，会请交通部门就这个问题进行了解，并检视相关规定，在政策上来看，原有的“小三通”航线有它的意义，可行的话，希望让航线继续维持。台交通部长贺陈旦说，会先对于航线亏损情形进行了解，对于相关补贴在法令上有没有适法的考虑，是否适合动用第二预备金及应该设定什么条件，在完整了解后，会一起向当局争取。
早年大陆提出有关两岸“大三通”（通商、通航、通邮）的构想，但当时的陈水扁政府为了迴避“一中原则”及“大三通”，于是在2001年单方面实施“小三通”，主要是指金门、马祖、澎湖与福建沿海地区的海上通航。
“大三通”后业务量萎缩
2008年5月国民党再次上台，两岸在“九二共识”的政治基础上，两会恢復事务性协商，签署了赴台游、直航等多项协议，两岸“大三通”也正式实施。两岸交通较以前更为便利，使得早年开通的“小三通”中的两岸海上客运面临严峻挑战。
早在2013年岛内交通部航港局就表示，马祖;小三通&在两岸“大三通”后，业务量萎缩。